בעקבות הדיווח אודות אירועי ההתפרצות לבסיס, נפתחה חקירה ביחידה ללוחמה בפשיעה בתחנת משטרת באר שבע. מהחקירה עלה כי הפורצים גרמו נזק וגנבו תחמושת מכלי רכב קרביים משוריינים (רק"מ) אשר עמדו באחסון.
החשוד, סולימאן אבו רקיק (20), הובא לבית המשפט לדיון שבו טענה המשטרה כי נחקרים שני אירועים של גניבת תחמושת מבסיסי צה"ל: ב-9 וב-14 בפברואר. "מדובר בכמה מעורבים שחדרו לשטח צבאי סגור דרך פרצה בגדר וגנבו תחמושת מכל מיני מקומות", אמר נציג המשטרה. "אירוע ביטחוני חמור, המצריך תעוזה רבה. יש בתחמושת הזאת כדי להביא למותם של אנשים".
החשוד, בעל עבר פלילי שמיוצג על ידי עו"ד עידו פורת, הכחיש את הפריצה המיוחסת לו לבסיס שדה תימן. השופטת אורית ליפשיץ קבעה כי מדובר "בחשד שיש לו אחיזה בחומר החקירה, ואין מדובר בהשערה בעלאמא". מעצרו של החשוד הוארך פעמיים, עד 23 בפברואר.
בפעילות מבצעית אותר חשוד נוסף בביתו, אף הוא צעיר מתל שבע (20), שנעצר ויובא מחר בפני שופט בבית משפט השלום בבאר שבע (18 פברואר).
