מבקר המדינה יוסף שפירא הודיע כי יפתח בבדיקת פרשת הצוללות וכלי השיט. המבקר פנה ליועץ המשפטי לממשלה, אביחי מנדלבליט, כדי לוודא כי חקירת המשטרה הסתיימה ואין מניעה לפתוח בבדיקה מטעמו. לפני כשלושה חודשים הועבר תיק החקירה לפרקליטות.
התנועה לטוהר המידות פנתה בחודש נובמבר אל שפירא, בדרישה שיפתח בבדיקת הפרשה, על רקע המלצות המשטרה להעמיד לדין בכירים, בהם ראש לשכת ראש הממשלה לשעבר דוד שרן, עו"ד דוד שמרון ואלוף אליעזר צ'ייני מרום.
התנועה לטוהר המידות, באמצעות עו"ד מלי פולישוק-בלוך ועו"ד יובל יועז, ביקשה לבדוק לעומק את תהליכי קבלת החלטות במשרד ראש הממשלה ובמשרד הביטחון ואת התנהלות הרכש הביטחוני ורכישת הצוללות שלא על דעת שר הבטחון דאז בוגי יעלון. עוד ביקשה התנועה כי ייבדקו ניגודי העניינים והצהרות האמת בהעסקתם של שליחי ראש הממשלה, עו"ד שמרון ועו"ד יצחק מולכו ואת ממשק הפרשה לראש הממשלה.
